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Welche PCR Technik?

Fish992011-06-09 13:55:27

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Beitrag #1
Hallo zusammen!

Ich hab einen Datensatz erhalten, bei dem ich mehrere Sequenzen mit einer Größe von etwa 250bp erhalten habe.
Mein Ziel ist es, nun auf der Grundlage und einer PCR größere Produkte davon zu vervielfältigen.
Also würde ich gerne Primer designen, die in dem bekannten Stück ansetzen und dann quasi in beide Richtungen nach "außen" amplifizieren. Wie mach ich das am besten? Einen Primer designen und quasi für den anderen nen universalen Primer nehmen?
Es handelt sich übrigens um bakt. 16S.

Vielen Dank schonmal
acribio2011-06-09 14:10:10

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Beitrag #2
Hallo,

und wie wäre es, wenn Du einfach in der Gendatenbank schaust?
Dort sind vielleicht die Sequenzen schon hinterlegt?
Wenn nicht, dann vielleicht aus Organismen mit Homologien.
Von diesen könnte man Primer ableiten.
Fish992011-06-10 09:19:06

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Beitrag #3
Leider sind es vollkommen unbekannte Taxa, mit denen wir hier grade . Es gibt zwar Primer, die gruppenspezifisch sind, wir wollen aber genau mit dem Taxon was machen...
Beiträge 1 bis 3 von 3 angezeigt.

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