Signalstärke |
| Nicki | 2009-02-24 15:50:19 |
Profil
Beitrag #1 • | Hallo,
kennt jemand ein kostenloses Programm, mit dem man die Lichtintensität messen kann, beispielsweise zur Abschätzung der Signalstärke in Etidiumbromidgelen? | | acribio | 2009-02-25 16:09:37 |
Profil
Beitrag #2 • | Also die Bestimmung der Bandenintensität ist vermutlich noch mehr mit Fehlern behaftet, als die Bestimmung der Bandengröße in Basenpaaren.
Da spielen Sättigungseffekte eine Rolle, die Bande verarmt mit der Zeit auch an Ethidiumbromid, und und und...
Von der Bandenintensität auf die Menge zu schliessen ist Kaffesatzleserei. Es gibt hierzu käufliche Vergleichsmarker die die einzelnen Banden in bekannter Menge enthalten, so dass ein vager optischer Vergleich möglich wird. Aber das hilft nicht viel.
Bedenke: Auch zum "richtigen" messen einer DNA-Menge mit UV-Spektrometer gehört meiner Meinung nach sehr viel Erfahrung und das ist auch noch mit großen Fehlern behaftet.
| | Nicki | 2009-02-26 16:41:21 |
Profil
Beitrag #3 • | Hi.
Du hast recht, aber ich brauche eine ungefähre abschätzung, um zwei signale zu vergleichen. und da scheint mir, als wäre das die vernünftigste Methode. | | acribio | 2009-02-26 17:33:41 |
Profil
Beitrag #4 • | Ich hatte mal so ein Programm, mit dem konnte man die Banden auf eingescannten Filmen quasi "integrieren" d.h. die Schwärzungen mit Maus umrahmen und zu einem Summenwert der Schwärzung zusammenrechnen... | | Nicki | 2009-02-27 16:04:34 |
Profil
Beitrag #5 • | dann hat das programm auch einen unterschied zwischen schwarz und "schwarz" gemacht? oder quasi nur die Fläche gemessen? | | acribio | 2009-03-02 15:04:07 |
Profil
Beitrag #6 • | neene, das hat schon den "Schwarzwert" genommen, der bei einm Gif zwischen 0 und 255 liegen kann.
Wenn man das nämlich gemacht wird, dann ist auch die aufgezogene Fläche egal, wenn der Hintergrund weiss ist. Das Integral der "Bande" ist recht genau.
| | Nicki | 2009-03-02 16:33:29 |
Profil
Beitrag #7 • | Ok, ich habe jetzt ein Programm gefunden, werde es später ausprobieren...
Eine dumme Frage hätte ich dann aber noch: wenn ich jetzt zwei Signale vergleiche, sagen wir mal zwei unterschiedliche Banden a un b, die bei einer PCR mit 30 Zyklen entstanden sind. Bande a ist viel "schwärzer" und ich erhalte ein doppelt so starkes Signal.
Im nächsten Fall untersuche ich nun diese zwei Banden, aber die PCR wurde mit 50 Zyklen gemacht. Dann wird doch der Unterschied zwischen Bande a und b immer größer?! Wie bekomme ich diesen Faktor weg? Oder kann man das so nicht machen? | | acribio | 2009-03-02 16:55:15 |
Profil
Beitrag #8 • | schau dir mein erstes Posting an. Ich muss dir sagen, lass es lieber. Was du da misst ist nicht sinnvoll.
Mein Prof hat einmal gesagt: "Es ist ja noch die Frage, was misst man eigentlich mit so einem Film..."
Auf deine Fragestellung bezogen: "ich erhalte ein doppelt so starkes Signal, was heisst das jetzt? Ist die Ausbeute doppelt so groß?"
Mit einer Eichkurve sieht es vielleicht schon besser aus! Also versuche deine Werte In eine Eichkurve hineinzubringen, dann kann man vermutlich mehr aussagen. | | Beiträge 1 bis 8 von 8 angezeigt. |
